A、调查土壤动物丰富度采用标志重捕法法，样方法用于调查植物的丰富度，A错误；B、观察肉眼难识别的小动物使用放大镜，B错误；C、统计土壤动物丰富度采用记名计算法和目测估计法，C正确；D、调查水中小动物类群丰富度采用取样调查，D错误．故选：C．
